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基因表達調控的研究,應用是多方面的,也是闡述機理的最基礎、最有效的手段。但是對于剛開(kāi)始進(jìn)行的研究人員來(lái)說(shuō),便會(huì )遇到多方面的問(wèn)題。為此,在本專(zhuān)題伊始之初,廣州賽誠生物科技有限公司整理了在基因表達調控研究中,涉及到的一些基礎性概念,以便大家更好的進(jìn)入基因表達調控研究的領(lǐng)域。
圖1 真核生物基因表達調控過(guò)程
基因(gene):現代生物學(xué)研究表明,一個(gè)生物系統所有類(lèi)型細胞具有相同的基因組。
基因(遺傳因子)是遺傳變異的主要物質(zhì)?;蛑С种?zhù)生命的基本構造和性能。儲存著(zhù)生命的種族、血型、孕育、生長(cháng)、凋亡過(guò)程的全部信息。環(huán)境和遺傳的互相依賴(lài),演繹著(zhù)生命的繁衍、細胞分裂和蛋白質(zhì)合成等重要生理過(guò)程。生物體的生、長(cháng)、病、老、死等一切生命現象都與基因有關(guān)。它也是決定生命健康的內在因素。因此,基因具有雙重屬性:物質(zhì)性(存在方式)和信息性(根本屬性)。
1 結構基因:基因中編碼RNA或蛋白質(zhì)的堿基序列。
(1)原核生物結構基因:連續的,RNA合成不需要剪接加工;
(2)真核生物結構基因:由外顯子(編碼序列)和內含子(非編碼序列)兩部分組成
2 非結構基因:結構基因兩側的一段不編碼的DNA片段(即側翼序列),參與基因表達調控。
(1)順式作用元件:能影響基因表達,但不編碼RNA和蛋白質(zhì)的DNA序列;
其中包括:
啟動(dòng)子:RNA聚合酶特異性識別結合和啟動(dòng)轉錄的DNA序列。有方向性,位于轉錄起始位點(diǎn)上游。
上游啟動(dòng)子元件:TATA盒上游的一些特定DNA序列,反式作用因子可與這些元件結合,調控基因的轉錄效率。
反應元件:與被激活的信息分子受體結合,并能調控基因表達的特異DNA序列。
增強子:與反式作用因子結合,增強轉錄活性,在基因任意位置都有效,無(wú)方向性。
沉默子:基因表達負調控元件,與反式作用因子結合,抑制轉錄活性。
Poly(A)加尾信號:結構基因末端保守的AATAAA順序及下游GT或T富含區,被多聚腺苷酸化特異因子識別,在mRNA 3′端加約200個(gè)A。
(2)反式作用因子:能識別和結合特定的順式作用元件的核心序列,并影響基因轉錄的一類(lèi)蛋白質(zhì)或RNA。對基因表達調控可正(激活)可負(阻遏)。
其中包括:基本轉錄因子(通用轉錄因子)、 上游轉錄因子(組織特異性轉錄因子)、可誘導轉錄因子等。
基因表達(gene expression):是指細胞在生命過(guò)程中,把儲存在DNA順序中遺傳信息經(jīng)過(guò)轉錄和翻譯,轉變成具有生物活性的蛋白質(zhì)分子。
生物體內的各種功能蛋白質(zhì)和酶都是同相應的結構基因編碼的?;虻谋磉_過(guò)程是將DNA上的遺傳信息傳遞給mRNA,然后再經(jīng)過(guò)翻譯將其傳遞給蛋白質(zhì)。在翻譯過(guò)程中tRNA負責與特定氨基酸結合,并將它們運送到核糖體,這些氨基酸在那里相互連接形成蛋白質(zhì)。這一過(guò)程由tRNA合成酶介導,一旦出現問(wèn)題就會(huì )生成錯誤的蛋白質(zhì),進(jìn)而造成災難性的后果。值得慶幸的是,tRNA分子與氨基酸的匹配非常精確,只不過(guò)迄今為止人們對這種機制還缺乏足夠的了解。
基因表達調控(regulation of gene expression or gene control):對基因表達過(guò)程的調節即為基因表達調控。
基因表達調控主要表現在以下幾個(gè)方面:①轉錄水平上的調控;②mRNA加工、成熟水平上的調控;③翻譯水平上的調控。
原核生物的基因表達調控雖然比真核生物簡(jiǎn)單,現已搞清楚了細菌的幾個(gè)操縱子模型,如:乳糖操縱子和色氨酸操縱子。真核生物細胞的組織多樣性以及基因結構比原核生物更加復雜,基因調控范圍更大,真核生物基因表達調控網(wǎng)絡(luò )機制很復雜。
1轉錄調控:轉錄水平調控是真核基因表達調控的重要環(huán)節。根據真核基因表達是否受環(huán)境影響可分為:發(fā)育調控和瞬時(shí)調控。其中發(fā)育調控是指真核生物為確保自身生長(cháng)、發(fā)育、分化等對基因表達按“預定”和“有序”的程序進(jìn)行的調控,是不可逆的過(guò)程;瞬時(shí)調控是指真核生物在內、外環(huán)境的刺激下所做出的適應性轉錄調控,是可逆過(guò)程
2轉錄后調控:基因轉錄后在mRNA加工、翻譯等過(guò)程中的調節。
參與調控的蛋白,在真核細胞中,稱(chēng)為轉錄調控因子(transcription factors,TFs),而在原核細胞中,則常稱(chēng)為調節蛋白(regulatory protein)。每個(gè)調控蛋白的結合位點(diǎn)通常都有特定的模式,被稱(chēng)為模體(motif)。