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lncRNA的概述

長(cháng)鏈非編碼RNALong non-coding RNA,lncRNA)是一類(lèi)本身不編碼蛋白,長(cháng)度在200-100000 nt之間的RNA分子。它可在多層面上(表觀(guān)遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達。lncRNA最初被認為是RNA聚合酶II轉錄的副產(chǎn)物,是一種噪音,不具有生物學(xué)功能。研究表面,lncRNA參與了X染色體沉默、染色體修飾和基因組修飾、轉錄激活、轉錄干擾、核內運輸等過(guò)程,其調控作用正在被越來(lái)越多的人研究。

LncRNA可分為五類(lèi):Antisense lncRNA(反義長(cháng)非編碼RNA),Intronic transcript (內含子非編碼RNA),Large intergenic noncoding RNAlincRNA),Promoter-associated lncRNA(啟動(dòng)子相關(guān)lncRNA)以及UTR associated lncRNA(非翻譯區lncRNA)。

哺乳動(dòng)物蛋白編碼基因占總RNA1%,長(cháng)鏈非編碼RNA占總RNA的比例可達4%-9%,這些長(cháng)鏈非編碼RNA是基因功能研究的又一座寶庫。目前發(fā)現的許多lncRNA都具有保守的二級結構,一定的剪切形式以及亞細胞定位。它們在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置,可以分為5種:正義鏈(sense)、反義鏈(antisense)、雙向(bidirectional)、內含子間(intronic)、基因間(intergenic),其所在的位置與其功能有一定的相關(guān)性。

 

2 F1不同位置lncRNA示意圖.png

1 不同位置lncRNA示意圖

 

LncRNA具有以下特點(diǎn):

1 lncRNAs通常較長(cháng),具有mRNA樣結構,經(jīng)過(guò)剪接,具有polyA尾巴與啟動(dòng)子結構,分化過(guò)程中有動(dòng)態(tài)的表達與不同的剪接方式。

2 有組織特異性與時(shí)空特異性,不同組織之間的lncRNA表達量不同,同一組織或器官在不同生長(cháng)階段,其中的lncRNA表達量也會(huì )變化。

3 調控多樣性,lncRNA可從染色質(zhì)重塑、轉錄調控及轉錄后加工等多種層面實(shí)現對基因表達的調控。lncRNAs啟動(dòng)子同樣可以結合轉錄因子,如Oct3/4,Nanog, CREB, Sp1, c-myc, Sox2p53,局部染色質(zhì)組蛋白同樣具有特征性的修飾方式與結構特征。

4 序列上保守性較低,只有約12%lncRNA可在人類(lèi)之外的其它生物中找到。

5 在腫瘤與其他疾病中有特征性的表達方式。


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