相對于蛋白編碼序列以及小分子RNA來(lái)說(shuō)，lncRNA的研究還僅僅處于起步階段。隨著(zhù)對lncRNA在哺乳動(dòng)物進(jìn)化及疾病發(fā)生發(fā)展中作用的關(guān)注，lncRNA的機制已成為現代遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題。然而，迄今為止，人們對于哺乳動(dòng)物細胞內lncRNA調控機制的認識仍存在許多障礙，包括它們的數量比例及它們的作用機制。因此，提高對lncRNA等非編碼轉錄本的關(guān)注，對真核細胞基因編程中進(jìn)化更新和功能性RNA家族的擴大是很重要的。比如，最初認為lncRNA的作用途徑是獨立的,且有明顯區別。但近年研究報道這些作用途徑的界限已開(kāi)始模糊，其中有些lncRNA之間存在交互作用，并構成一基因調控網(wǎng)絡(luò )。如果大部分非編碼RNA被證明是有功能的,那么它們的特性將對我們認識復雜有機體的基因編程有很大影響，也會(huì )帶給我們關(guān)于進(jìn)化、發(fā)育和疾病等老問(wèn)題的新的答案。

當前，lncRNA研究正處于起步階段，因此面臨著(zhù)許多亟待解決的問(wèn)題：

（1）lncRNA的定義仍存在爭議。一般認為，lncRNA是長(cháng)度大于200個(gè)核苷酸的非編碼RNA。但是，Spizzo等認為，以200個(gè)核苷酸作為界定lncRNA過(guò)于武斷，因為小于200個(gè)核苷酸的非編碼RNA中還存在很多非編碼RNA，它們既不屬于小RNA（Small RNA）也不屬于結構RNA（Structural RNA）。

（2）lncRNA生物學(xué)功能的闡明并非易事。一方面，如何區分功能性和非功能性非編碼轉錄物依然存在困難；另一方面，由于lncRNA種類(lèi)和功能的多樣性，致使不同的lncRNA研究結果之間的借鑒意義并不高。

（3）尚無(wú)統一的命名原則。目前lncRNA還沒(méi)有一個(gè)規范的命名方法，只是研究者根據其功能、結構特點(diǎn)、作用方式等進(jìn)行命名，有時(shí)很難從名稱(chēng)中了解其真正含義和功能。

（4）lncRNA數據庫不夠全。相對于其他非編碼RNA數據庫，lncRNA相關(guān)數據庫的內容還不夠全，對lncRNA的注釋遠遠不夠豐富。

（5）lncRNA功能預測的工具不多。針對lncRNA的生物信息學(xué)工具仍然極少，例如，目前難以對lncRNA二級結構和靶標等進(jìn)行有效地預測。

（6）研究領(lǐng)域有待拓展。目前，有關(guān)lncRNA的研究主要集中于腫瘤、神經(jīng)、發(fā)育、植物等領(lǐng)域，在其他領(lǐng)域和對其他疾病的研究依然欠缺。

（7）用于lncRNA研究的新技術(shù)并不多。因此，需要建立更多、更有效的研究方法用于系統地研究lncRNA的結構和功能。

隨著(zhù)越來(lái)越多的研究者關(guān)注并且投身到lncRNA研究領(lǐng)域中，我們對lncRNA的認識也正越來(lái)越深入。lncRNA不僅在生物體中以多種機制發(fā)揮其生物學(xué)功能，而且其功能失調與多種疾病的發(fā)生和發(fā)展有關(guān)。目前研究也發(fā)現，lncRNA與腫瘤發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系非常密切。  然而，由于lncRNA作用機制的多樣和復雜，目前對lncRNA功能的認識仍然只是冰山一角。來(lái)自DNA元件百科全書(shū)（Encyclopedia of DNA Elements，ENCODE）的數據表明，迄今為止，該項目所收錄的9640多個(gè)人類(lèi)lncRNA基因位點(diǎn)中，只有約100個(gè)得到了功能研究。為了闡明lncRNA精細的分子機制，需要更先進(jìn)的高分辨率體內成像技術(shù)和高靈敏度檢測技術(shù)。例如，Paige等開(kāi)發(fā)出一種稱(chēng)為“Spinach”的RNA-熒光基團復合物便可用于動(dòng)態(tài)追蹤活細胞內的RNA；Mercer等也于最近開(kāi)發(fā)了一種稱(chēng)為“RNA CaptureSeq”的靶向RNA測序技術(shù)，具有極高的靈敏度，可以檢測到常規測序方法無(wú)法檢測到的微量RNA和瞬時(shí)表達的RNA。他們利用該技術(shù)檢測到了163種新的lncRNA。我們相信，隨著(zhù)技術(shù)的進(jìn)步，將有更多的新技術(shù)運用于lncRNA的功能研究中，這必將有助于我們進(jìn)一步解析lncRNA的功能及其分子調控機制，以及它們在疾病發(fā)生、發(fā)展中的病理機制。

• 1 . miRNA的概述
  • 1.1. miRNA的生物發(fā)生
  • 1.2. miRNA的作用機制
  • 1.3. miRNA的研究展望
  • 1.4. miRNA與癌癥
  • 1.5. miRNA在轉化醫學(xué)中的應用
• 2 . lncRNA的概述
  • 2.1. lncRNA的研究背景
  • 2.2. lncRNA的作用機制
  • 2.3. lncRNA的研究展望
  • 2.4. lncRNA與癌癥
  • 2.5. lncRNA與臨床疾病
• 3 . miRNA與lncRNA研究策略
  • 3.1. miRNA的一般研究策略
  • 3.2. AGO2在miRNA研究中的應用
  • 3.3. LncRNA的一般研究策略
  • 3.4. miRNA與lncRNA的生物信息學(xué)預測
• 4 . miRNA與lncRNA研究實(shí)驗
  • 4.1. RNA 結合蛋白免疫沉淀技術(shù)（RIP）Model Figures
  • 4.2. RNA結合蛋白免疫沉淀技術(shù)（RIP）實(shí)驗流程
  • 4.3. RNA結合蛋白免疫沉淀技術(shù)（RIP）實(shí)驗常見(jiàn)問(wèn)題
  • 4.4. RNA pull - down Model Figures
  • 4.5. RNA pull- down實(shí)驗流程
  • 4.6. RNA pull- down實(shí)驗常見(jiàn)問(wèn)題
  • 4.7. 熒光素酶檢測技術(shù)（Luciferase）Model Figures
  • 4.8. 熒光素酶檢測技術(shù)（Luciferase）實(shí)驗流程
  • 4.9. 熒光素酶檢測技術(shù)（Luciferase）實(shí)驗常見(jiàn)問(wèn)題