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實(shí)驗技術(shù)流程
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實(shí)驗常見(jiàn)問(wèn)題
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結果分析
對于一幅ChIP-qPCR實(shí)驗結果Figure，應包含位點(diǎn)作用示意圖、qPCR結果數據分析圖，并應在Supplement中補充相關(guān)的驗證性實(shí)驗圖片，具體如下圖所示。
Figure A：
未處理組（Mock）與處理組（Treat）RNA聚合酶II分別與目的基因啟動(dòng)子調控區域A區域、D區域、G區域的結合。處理后RNA聚合酶II與A區域、G區域結合明顯增加，D區域結合情況未有明顯變化。
Figure B：
未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉錄因子1（TF1）分別與目的基因啟動(dòng)子調控區域A區域、B區域、C區域、D區域、E區域、F區域、G區域、H區域、I區域的結合情況比較。未處理組（Mock）：轉錄因子1（TF1）與目的基因啟動(dòng)子調控區域A、B、G、H有結合，但與D、E、I區域有不明顯的少量結合，且與C、F組不結合。處理組（Treat）：轉錄因子1(TF1)與目的基因啟動(dòng)子調控區域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結合，且與A、B、G、H區域的結合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且原本不結合的C、F區域處理后有少量結合，對D、E、I區域的結合情況無(wú)明顯改變。
Figure C：
未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉錄因子2（TF2）分別與目的基因啟動(dòng)子調控區域A區域、B區域、C區域、D區域、E區域、F區域、G區域、H區域、I區域的結合情況。未處理組（Mock）：轉錄因子2（TF2）與目的基因啟動(dòng)子調控區域G、H有明顯結合，與A、B、C、I區域有少量的結合，且與D、F組不結合。處理組（Treat）：轉錄因子2(TF2)與目的基因啟動(dòng)子調控區域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結合，且與A、B、G、H區域的結合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且與C、I區域的結合經(jīng)處理后也有提升，與且原本不結合的D、F區域處理后有少量結合，對E區域的結合情況無(wú)改變。
Figure D：
未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉錄因子2（TF2）分別與目的基因啟動(dòng)子調控區域Chr1.3q4（1號染色體3q4座位）的區域：A區域、B區域、C區域、D區域、E區域、F區域、G區域、H區域、I區域的結合情況。未處理組（Mock）：H3K7Ac（3號組蛋白7號賴(lài)氨酸位點(diǎn)乙?；揎椀鞍祝┡c目的基因啟動(dòng)子調控區域A,B C G、H有明顯結合，與D、E、F、I區域有少量的結合。處理組（Treat）：H3K7Ac（3號組蛋白7號賴(lài)氨酸位點(diǎn)乙?；揎椀鞍祝┡c目的基因啟動(dòng)子調控區域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結合，且與A、B、C、G、H、I區域的結合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且與D、E區域的結合經(jīng)處理后也有少量提升。
Supplement：
A 預實(shí)驗：WB檢測轉錄因子在細胞核內表達
B 細胞核抽提物被經(jīng)過(guò)超聲波打斷或核酸酶酶解后DNA電泳，表示基因組DNA被打斷成500bp左右的片段，方便后續的免疫共沉淀實(shí)驗。
C ChIP-qPCR實(shí)驗后，體系內的DNA片段擴增物進(jìn)行DNA電泳，檢測qPCR擴增產(chǎn)物是否和設計相符，以及檢測是否有引物二聚體產(chǎn)生影響實(shí)驗。
