廣州市黃埔區學(xué)大道攬月路廣州企業(yè)孵化器B座402
電話(huà)：020-85625352
手機：18102256923、18102253682
Email：servers@gzscbio.com
Fax：020-85625352
QQ：386244141
項目名稱(chēng)：Histone-Chip
所屬分類(lèi)：生物信息學(xué)分析
聯(lián)系電話(huà)：020-85625352
QQ：386244141
Email：servers@gzscbio.com
技術(shù)服務(wù)描述
1. Histone-Chip
組蛋白(Histone)是什么？ 組蛋白是真核生物體細胞染色質(zhì)與原核細胞中的堿性蛋白質(zhì)，和DNA共同組成核小體結構。它們是染色質(zhì)的主要蛋白質(zhì)組分，作為DNA纏繞的線(xiàn)軸，并在基因調控中發(fā)揮作用。組蛋白存在五個(gè)主要的組蛋白家族：H1/H5、H2A、H2B、H3和H4。 組蛋白H2A，H2B，H3和H4被稱(chēng)為核心織蛋白（Core Histone）。核心組蛋白是高度保守的蛋白質(zhì)，意即組蛋白在氨基酸序列中有著(zhù)非常小的改變。
組蛋白功能有哪些？1. 填充蛋白質(zhì)：組蛋白作為DNA纏繞的線(xiàn)軸。 這使得能夠在細胞核內將真核細胞的大型的基因組所必需的壓實(shí)物：壓實(shí)的分子比未壓實(shí)的分子短40,000倍。 2. 染色質(zhì)調控：組蛋白進(jìn)行翻譯后修飾，以更改它與DNA及其他核蛋白的相互作用。組蛋白H3及H4有著(zhù)核小體伸出的長(cháng)尾巴，能夠在不同的地方進(jìn)行共價(jià)修飾。這種修飾包括有甲基化、瓜氨化、乙?；?/span>、磷酸化、小泛素相關(guān)修飾化、泛素化 及 二磷酸腺苷核糖基化。 組蛋白核心（即H2A及H3）亦可以作出修飾。修飾的組合可以組成編碼，成為組蛋白編碼。組蛋白修飾在不同的生物過(guò)程起著(zhù)作用，包括基因表觀(guān)調控、DNA修復、有絲分裂及減數分裂 。
1.1. 組蛋白修飾
組蛋白修飾與基因表達調控有關(guān)已經(jīng)被廣泛的證明了。常見(jiàn)的組蛋白修飾的類(lèi)型：
組蛋白修飾的命名？
先以組蛋白名稱(chēng)開(kāi)始，如H3；單一字母的氨基酸簡(jiǎn)稱(chēng)，如K代表賴(lài)氨酸，及在蛋白質(zhì)的位置；及修飾的種類(lèi)，Me即甲基化、P即磷酸化、Ac即乙?；癠b即泛素化。舉例來(lái)說(shuō)，H3K4Me就代表組蛋白H3從N端開(kāi)始起計第4個(gè)賴(lài)氨酸的甲基化。示例H3K27me3如下，它表示組蛋白H3蛋白亞基上的賴(lài)氨酸27的三甲基化：
| 縮寫(xiě) | 含義 |
|---|---|
| H3 | H3家族的組蛋白 |
| K | 賴(lài)氨酸(lysine)的標準縮寫(xiě) |
| 27 | 氨基酸殘基位置（從N端開(kāi)始計數） |
| me | 甲基化 |
| 3 | 甲基化數量 |
1.2. 常見(jiàn)的組蛋白修飾
簡(jiǎn)介：
H3K27ac
H3K27ac是DNA包裝蛋白Histone H3的表觀(guān)遺傳修飾。這是表明組蛋白H3蛋白N端27位賴(lài)氨酸殘基乙?；?/span>的標記。
H3K27ac與轉錄的更高激活相關(guān)，因此被定義為活性增強子標記。H3K27ac被發(fā)現在轉錄起始位點(diǎn)（TSS）的近端和遠端區域。
H3K27me3
H3K27me3是DNA包裝蛋白Histone H3的表觀(guān)遺傳修飾。這是表明組蛋白H3蛋白上賴(lài)氨酸27的三甲基化的標記。
這種三甲基化通過(guò)形成異色區域與附近基因的下調相關(guān)。
H3K4me1
H3K4me1是DNA包裝蛋白Histone H3的表觀(guān)遺傳修飾。這是表明組蛋白H3蛋白第4個(gè)賴(lài)氨酸殘基的單甲基化標記。
通常與基因增強子有關(guān)。
H3K4me3
H3K4me3是DNA包裝蛋白Histone H3的表觀(guān)遺傳修飾。這是表明組蛋白H3蛋白第4個(gè)賴(lài)氨酸殘基的三甲基化標記。
通常參與基因表達的調節。
其他：
RNA-II
RNA聚合酶II（RNAP II和Pol II）是一種多蛋白復合物，可將DNA轉錄 成信使RNA（mRNA）和大多數小核RNA（snRNA）和microRNA的前體。
它是在真核細胞核中發(fā)現的三種RNAP酶之一。
RNAP II 是一個(gè)由 550 kDa 的12個(gè)亞基組成的復合體，是研究最多的RNA聚合酶類(lèi)型。
它需要多種轉錄因子才能與上游基因結合啟動(dòng)子并開(kāi)始轉錄。